في بغداد ، تم إنشاء أول صيدليات أو مخازن للأدوية عام 754 ، في ظل الخلافة العباسية خلال العصر الذهبي الإسلامي. بحلول القرن التاسع ، كانت هذه الصيدليات تنظمها الدولة.
قادت التطورات التي تحققت في الشرق الأوسط في علم النبات والكيمياء الطب في الإسلام في العصور الوسطى إلى تطوير علم العقاقير بشكل كبير. محمد بن زكريا رازي (الرازي) (865-915) ، على سبيل المثال ، عمل على تعزيز الاستخدامات الطبية للمركبات الكيميائية. أبو القاسم الزهراوي (أبو القاسم) (936-1013) كان رائداً في تحضير الأدوية عن طريق التسامي والتقطير. إن كتابه Liber servitoris له أهمية خاصة ، حيث أنه يزود القارئ بالوصفات ويشرح كيفية تحضير "البساطة" التي تم من خلالها تجميع الأدوية المعقدة المستخدمة بشكل عام. كان صابر بن سهل (توفي عام 869) ، مع ذلك ، أول طبيب يشرع في إعداد دستور الأدوية ، واصفًا مجموعة كبيرة ومتنوعة من الأدوية والعلاجات للأمراض. كتب البيروني (973-1050) أحد أهم الأعمال الإسلامية في علم العقاقير بعنوان "كتاب الصيدلة" ، حيث قدم معرفة تفصيلية بخصائص الأدوية وأوضح دور الصيدلة ووظائفها وخصائصها. واجبات الصيدلي. كما وصف ابن سينا ​​(ابن سينا) ما لا يقل عن 700 من المستحضرات وخصائصها وطريقة عملها ودلالاتها. لقد كرس في الواقع مجلدًا كاملاً للأدوية البسيطة في قانون الطب. كما كان لأعمال المريديني في بغداد والقاهرة تأثير كبير ، وأعمال ابن الوافيد (1008-1074) ، وكلاهما طُبِع باللاتينية أكثر من خمسين مرة ، وظهر على أنهما De Medicinis universalibus et specialibus لـ "Mesue" الأصغر ، و Medicamentis Simplicibus من Abenguefit. قام بيتر الأبانو (1250–1316) بترجمة وإضافة ملحق لعمل المريديني تحت عنوان De Veneris. كما أن مساهمات الموفق في هذا المجال رائدة أيضًا. عاش في القرن العاشر ، كتب أسس الخصائص الحقيقية للعلاجات ، من بين أمور أخرى وصف أكسيد الزرنيخ ، والتعرف على حمض السيليك. لقد ميز بوضوح بين كربونات الصوديوم وكربونات البوتاسيوم ، ولفت الانتباه إلى الطبيعة السامة لمركبات النحاس ، وخاصة النحاس الزجاجي ، وكذلك مركبات الرصاص. كما يصف تقطير مياه البحر للشرب.